به دنبال اعدام علی اشتری و اعلام بازداشت سه نفر به اتهام جاسوسی برای اسرائیل از سوی فرمانده کل سپاه ‏پاسداران، برخی منابع غیر رسمی در ایران از بازداشت چند تن از دانشمندان هسته ای و چند نفر از دست ‏اندرکاران مرتبط با تحقیقات اتمی خبر می دهند.‏ سایت تابناک وابسته به محسن رضایی فرمانده اسبق سپاه پاسداران در این خصوص گزارش داد که اتهام چند نفر ‏از محققان هسته ای از سوی نهادهای امنیتی جمهوری اسلامی “ارتباط با خارج” و “لو دادن برخی نتایج برخی ‏تحقیقات و برنامه‌های هسته ای” عنوان شده است.‏ بنابر همین گزارش بازداشت این افراد “در ماه های گذشته” و پس از انتشار اخباری صورت گرفت که حکایت ‏داشت “سرویس‌های جاسوسی غربی و به ویژه آمریکا صراحتا جاسوسی و کشف اطلاعات از فعالیت‌های هسته‌ای ‏ایران را سرلوحه کار خود قرار داده‌اند.”‏ سایت تابناک نیز در همن خصوص خبر داد که افراد بازداشت شده “در بخش‌های تحقیقاتی و علمی در ارتباط با ‏دانش هسته‌ای مشغول به فعالیت بوده‌اند‎.‎‏”‏ تیرماه امسال خبرگژاریهای نزدیک به دولت از محاکمه یک تاجر تجهیزات مخابراتی و مراقبتی خبر دادند. وی ‏که علی اشتری نام داشت در دادگاه به جاسوسی برای اسرائیل متهمو به اعدام محکوم شد.‏ معاون ضد جاسوسی وزارت اطلاعات در اوایل آذر ماه اعلام کرد که حکم اعدام اشتری در ۲۸ آبان ۸۷ به اجرا ‏در امده است.‏ وی همچنین گفت که اشتری پس نفوذ به نهادهای حساس امنیتی و انتظامی به فروش “محصولات آلوده به ‏تجهیزات مراقبتی و جاسوسی” به آنها اقدام کرده است.‏ یک روز بعد از این خبر محمود علی جعفری فرمانده کل سپاه پاسداران نیز از جنگ اطلاعاتی با اسرائیل خبر داد ‏و گفت که اخیرا ۳ جاسوس اسرائیل از سوی حفاظت و اطلاعات سپاه پاسداران بازداشت شده اند.‏ سعید مرتضوی دادستان تهران نیز در همین خصوص به خبرگزاری های مهر و ایرنا گفت که سردسته این سه ‏جاسوس عضویت بسیج را داشته است.‏ ‎‎مرگ مشکوک دانشمندان‎‎ خبر بازداشت تعدادی از محققان هسته ای ایران، در شرایطی اعلام می شود که پرونده مرگ مشکوک اردشیر ‏حسین پور دانشمند هسته ای ایرانی، هنورز در پرده ابهام قرار دارد. ‏ اردشیر حسین پور یکی از دانشمندان هسته ای ایران، دوشنبه ۲۵ دی ماه ۸۵ در خوابگاه صدرای شیراز که تدابیر ‏ویژه امنیتی در آن لحاظ شده بود، در حالی که تنها ۴۰ سال داشت درگذشت.‏ علت این دانشمند هسته ای هرگز به طور رسمی اعلام نشد، اما برخی مقامات به صورت غیر رسمی گفتند که وی ‏به علت “گازگرفتگی” جان باخته، و رسانه های رسمی تنها اخباری از تشییع جنازه او را منتشر کردند.‏ وی که‏‎ ‎پس از پایان تحصیلات در رشته مهندسی الکترونیک، دکترای هسته ای را با تز “فیزیک هسته‎ ‎ای ‏الکترودینامیک یون های مغناطیسی در ابرشبکه ها” کسب کرده بود، در طراحی و اجرای برخی از پروژه های ‏مهم موشکی و نظامی جمهوری اسلامی نقش موثری داشت و دوبار در جشنواره خوارزمی به عنوان محقق برتر ‏مورد تجلیل قرار گرفته بود. رسانه های نزدیک به مقامات حکومتی پس از انتشار خبر مرگ مشکوک این دانشمند ‏هسته ای و بازتاب های گسترده آن در دنیا از وی به عنوان یکی از طراحان سانتریفیوژ در ایران نام بردند.‏ در همان زمان برخی رسانه های خارج از کشور مرگ دانشمند هسته ای جمهوری اسلامی را به سرویس ‏اطلاعاتی اسرائیل نسبت دادند، خبری که خبرگزاری فارس به نقل از “یک منبع آگاه” آن را تکذیب کرد. این مقام ‏آگاه دو هفته پس از مرگ اردشیر حسین پور گفت: “هیچ یک از دانشمندان هسته‌اى ایران ترور نشده‌اند و موساد ‏قدرت عملیات در ایران را ندارد”. ‏ این در حالی بود که مدتی پس از آن، غلامرضا آقازاده و رییس سازمان انرژی اتمی ایران، در ۱۸ بهمن ۸۵ در ‏پاسخ به خبرگزاری مهر که از وی در خصوص”انتشار برخی اخبار، مبنی بر ترور یکی از متخصصان هسته ای ‏کشور به نام اردشیر حسین پور، توسط سرویس های اطلاعاتی بیگانه” پرسیده بود، گفت: “الحمدالله همه ‏متخصصان ما سالم هستند و هیچ اتفاقی نیافتاده و ما ترور چنین فردی را نداشته ایم.”‏ با این حال سایت رسمی مرکز اسناد انقلاب اسلامی که تحت نظر روح الله حسینیان که از نزدیکان به نهاد های ‏امنیتی در ۱۱ شهریور سال ۸۶ به از “بررسی دلایل مرگ حسین‌پور دانشمند هسته‌‌ای ایران” به نقل از ضمیمه ‏هفتگی روزنامه لارپوبلیکای ایتالیا سه فرضیه “ترور از سوی سرویس اطلاعاتی اسرائیل”، “مرگ اتفاقی” و ‏‏”قتل از سوی نهادهای امنیتی جمهوری اسلامی” را مورد اشاره قرار داد.‏